オンライン対戦モード「マーセナリー」搭載

EDF:IRには、オンライン協力プレイの他に、ふたつのチームに分かれてのエナジージェム争奪戦を行うオンライン対戦モードが搭載されている。ルールは至ってシンプル、「EDF」か「カインドレッド・レべリオン」のどちらかのチームに所属し、アグレッサーを倒して出現するエナジージェムを集め、黄色い回収ドローンに届ける、といった内容。
制限時間内により多くのエナジージェムを集めたチームが勝利となる。なお戦いはWave制で行われ、先に3Wave先取したチームが勝ちだ。